Se creó el primer árbol de la vida interactivo: todos los seres vivos en un diagrama

© 2016 Damien M. de Vienne.

Dado que la secuenciación del ADN se ha vuelto relativamente barata y rápida, los científicos han recibido una gran cantidad de datos sobre la relación genética de diferentes especies de seres vivos. El Centro Nacional de Información Biotecnológica de los Estados Unidos (NCBI) mantiene una de las bases de datos más grandes sobre filogenética (la ciencia de las relaciones evolutivas de los organismos). A octubre de 2016, contenía información sobre 1, 4 millones de especies.

Recientemente, se publicó un trabajo en la revista PNAS, en el que los científicos ofrecieron a sus colegas la primera versión completa del árbol filogenético de la vida: Open Tree of Life (OTOL). Sin embargo, solo los especialistas pueden usar este árbol: trabajar con él requiere muchos conocimientos y habilidades especiales, pero parece un programa de computadora con una interfaz compleja. Todavía no existía un árbol filogenético con una estructura interactiva simple y comprensible para el usuario promedio.

Ahora hay tal recurso. Damien de Vienne ha combinado métodos modernos de visualización de información (como OpenStreetMap) y ha desarrollado Lifemap, una plataforma en la que ha aparecido el Árbol de la Vida, que actualmente contiene información sobre las vistas 802 639 (en la versión para una amplia audiencia), existente y extinto.

© 2016 Damien M. de Vienne. El lugar del hombre en el dominio eucariota

Lifemap consta de tres grupos principales (dominios), cuya asignación fue sugerida en 1990 por el fundador de la filogenética molecular, Karl Woese. El primer dominio es arqueas, organismos unicelulares que no tienen núcleo u otros orgánulos: ahora hay 3733 especies de arqueas en el árbol. El segundo es bacterias (277, 426 especies), el tercero son eucariotas, es decir, organismos en las células de los cuales hay un núcleo (521480 especies hoy en día en el público en general de Lifemap). Estos incluyen muchos seres vivos, desde el agárico de mosca hasta el hombre.

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Puede hacer clic en todos los nodos del árbol para obtener información detallada sobre el taxón o la especie. Puede ingresar el nombre en inglés o latino de la especie u otro taxón en la barra de búsqueda. Usando el comando Ver ascendencia completa, puede rastrear el historial evolutivo de las especies seleccionadas, y al completar la segunda barra de búsqueda, puede encontrar el ancestro común más cercano de cualquiera de las dos especies que pertenecen al mismo dominio. Al mismo tiempo, el sistema proporciona una lista completa en la que se puede hacer clic de todos los antepasados ​​de ambas especies, hasta la común más cercana.

© 2016 Damien M. de Vienne. En Lifemap, puedes encontrar el ancestro común más cercano del lobo (Canis lupus) y los humanos (Homo sapiens)

Ahora Tree of Life existe en tres versiones, en las que se distingue el árbol en sí mismo, así como la cantidad y las fuentes de información que lo acompañan. La versión para un público amplio (Lifemap, público en general) incluye la posibilidad de agregar artículos de Wikipedia a las descripciones de las imágenes, y si no hay un artículo correspondiente, se invita al usuario a crear uno.

La versión Lifemap NCBI contiene la taxonomía completa de acuerdo con el NCBI y se actualiza una vez por semana. Al hacer clic en el nodo del árbol deseado, el usuario recibe información adicional sobre el número de especies en el taxón, un enlace a la página web de NCBI con una descripción del taxón y la capacidad de descargar la sección correspondiente del árbol. Si lo desea, en esta versión puede crear una capa adicional y mostrar todos los tipos del taxón indicado, cuyo genoma ya está secuenciado.

La tercera versión se llama Lifemap OTOL (Open Tree of Life). En él, el usuario verá un árbol filogenético según OTOL, que se describió anteriormente.

Una descripción detallada de Lifemap se publica en la revista PLOS Biology.

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